是雙一流大學。雙一流大學一般指世界一流大學和一流學科。南京中醫藥大學是世界一流學科建設高校,一流學科:中藥學。
世界一流學科建設學科(1個):中藥學
國家重點學科(3個):中藥學、中醫醫史文獻、中醫兒科學
國家重點(培育)學科(2個):中醫學、中醫內科學
江蘇省高校優勢學科建設工程(4個):中醫學、中藥學、中西醫結合、護理學
國家中醫藥管理局“十一五”重點學科(14個):方劑學、溫病學、中醫兒科學、中醫婦科學、中醫肝膽病學、針灸學、藥用植物學、中藥藥理學、中藥炮制學、中醫醫史文獻學、中醫護理學、中醫脾胃病學、中醫腎病學、中醫肛腸病學
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