具有較強的科技創新能力。有中醫學、中藥學、中西醫結合3個博士后科研流動站,設有4個研究所、6個研究室,2個國家中醫藥管理局重點研究室,3個山東省工程技術研究中心!笆晃濉币詠,共承擔廳局級以上科研課題739項,其中國家級項目143項。在省屬高校中首家主持國家“973”項目1項,承擔“973”項目課題3項,牽頭國家“十一五”科技支撐計劃項目4項,財政部“中醫藥古籍保護與利用能力建設”重大專項1項;國家重大、重點科研項目累計科研經費突破1億元,中醫臨床研究基地建設資金2.8億元;獲國家科技進步二等獎2項,省部級獎勵78項、廳局級獎勵77項。是科技部認定的“國家科技成果重點推廣項目技術依托單位”、“國家中藥現代化、產業化規范種植項目承擔單位”。
學校注重加強學科建設,形成了一批優勢和特色學科。現有中醫基礎理論、中醫醫史文獻2個國家重點學科和中醫內科學1個國家重點(培育)學科。1個教育部重點實驗室,1個國家衛生部技術準入專科;國家中醫藥管理局重點學科12個、重點專科(專病)3個、重點建設專科5個、重點實驗室6個;有山東拾泰山學者”崗位學科6個,山東省人文社科研究基地1個,省級重點學科、重點?、重點實驗室等14個。學校,以鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導,深入貫徹落實科學發展觀和黨的教育方針,以建設高水平特色名校為目標,以科學發展為主題,以人才培養為根本任務,以提高質量和科技創新為主線,以解放思想、深化改革為動力,凝聚全校師生的力量,統一思想,搶抓機遇,突出特色,奮發進取,以高昂的斗志、扎實的工作,全面推進高水平特色名校建設,正在為實現山東中醫藥大學新的歷史性跨越而努力奮斗!